精神疾病遺傳學(xué)研究進(jìn)展PPT演示課件
.,精神疾病遺傳學(xué)研究進(jìn)展,.,精神疾病的遺傳學(xué)研究,21世紀(jì)人類面對的最大疾患是精神疾病遺傳因素在許多常見的精神疾病中起著重要作用: 如精神分裂癥,雙相情感障礙,ADHD,孤獨(dú)癥,重性抑郁,阿爾茨海默病等雙生子研究,寄養(yǎng)子研究非孟德爾遺傳:多基因與環(huán)境因素共同作用的結(jié)果,.,部分常見精神疾病的遺傳度,.,主要挑戰(zhàn),遺傳異質(zhì)性同表型患者攜不同基因常見等位基因可從多個(gè)不同個(gè)體進(jìn)入一個(gè)家系基因的微效性多基因間的相互作用環(huán)境因素影響不完全顯性攜帶者不表現(xiàn)表型群體遺傳背景的影響群體分層(Population stratification)同一基因可能與不同疾病相關(guān)精神分裂癥與躁狂抑郁癥: G72/G30自閉癥與多動癥: serotonin transporter,.,傳統(tǒng)方法遺傳學(xué)研究方法,傳統(tǒng)方法基本可歸為兩類連鎖分析:單基因遺傳疾病效果好,在尋找復(fù)雜疾病的致病基因的過程中收效甚微。 候選基因關(guān)聯(lián)分析: 基于假說,選定一個(gè)或幾個(gè)候選基因進(jìn)行研究,研究的基因非常有限。,.,遺傳學(xué)研究的新方法,全基因組關(guān)聯(lián)分析外顯子測序拷貝數(shù)變異,.,全基因組關(guān)聯(lián)分析,全基因組關(guān)聯(lián)分析的設(shè)想最早由Risch 于1996年提出。(Science, 273:1516-1517)采用高通量的基因分型技術(shù),對覆蓋全基因組的遺傳標(biāo)志進(jìn)行基因分型,通過關(guān)聯(lián)分析來尋找全基因組中與疾?。ㄐ誀睿┫嚓P(guān)的基因。理論基礎(chǔ):連鎖不平衡常見疾病-常見變異(CDCV)模型,.,常見疾病-常見變異(CDCV)模型,疾病占人群的1%,每個(gè)致病基因在人群> 20%,每個(gè)單個(gè)致病基因在人群中占的比例更高.人群中多為“攜帶者”.單個(gè)基因的致病概率較低,.,全基因組關(guān)聯(lián)分析,全基因組關(guān)聯(lián)分析設(shè)想的實(shí)現(xiàn)得益人類基因組測序計(jì)劃和人類基因組單體型圖(HapMap)計(jì)劃的實(shí)施。覆蓋全基因組DNA序列SNPs位點(diǎn)??焖俑咄苛畠r(jià)的基因分型技術(shù)?;蛐酒话惆ㄎ迨f到一百萬個(gè)SNPs, 而且其中65-80%的SNP位點(diǎn)的稀有等位基因頻率大于5% 新的多態(tài)位點(diǎn):拷貝數(shù)變異(CNVs),.,國際全基因組關(guān)聯(lián)分析聯(lián)盟,Wellcome Trust Case-Control Consortium (WTCCC) 英國,2005年WTCCC1, 2008年WTCCC2,2009年WTCCC3包括雙相情感、精神分裂癥、精神疾病內(nèi)表型、神經(jīng)性厭食等精神疾病美國NIH基金會(Foundation for the National Institute of Health)的GAIN計(jì)劃(Genetic Association Information Network)六種常見疾病(注意缺陷多動障礙,雙相情感障礙、糖尿病腎病、重性抑郁、銀屑病和精神分裂癥),.,精神分裂癥全基因組關(guān)聯(lián)分析,.,外顯子測序,外顯子測序是2010年十大科學(xué)進(jìn)展之一。簡便、經(jīng)濟(jì),已成為現(xiàn)階段基因測序工作的重心。,外顯子測序是指利用序列捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區(qū)域DNA捕捉并富集后進(jìn)行高通量測序的基因組分析方法,.,精神疾病的外顯子測序,Xu 等人最近對精神分裂癥的核心家系進(jìn)行全基因組外顯子測序,發(fā)現(xiàn)40個(gè)新的突變。Nature Genetics (2011)。ORoak 等對孤獨(dú)癥患者進(jìn)行外顯子測序,結(jié)果發(fā)現(xiàn)11個(gè)嚴(yán)重基因突變(可引起蛋白質(zhì)的改變) Nature Genetics (2011)。外顯子測序的重點(diǎn)在于:發(fā)現(xiàn)新的突變,新的候選基因,.,拷貝數(shù)變異,拷貝數(shù)變異(copy number variations,CNVs)是指在基因組中拷貝數(shù)目與參考基因組相比存在變異的,長度大于1kb的DNA片段。CNVs所引起的個(gè)體間遺傳差異達(dá)可達(dá)5-24Mb,即使是最為保守的估計(jì),這一差異也可達(dá)4Mb(0.12%),大于SNPs所產(chǎn)生的約0.08%個(gè)體間遺傳差。,.,拷貝數(shù)變異分析方法,.,基于芯片的CNV分析方法,.,拷貝數(shù)變異與表型,.,The end,Thank you !,.,18,