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1、第二十章 生物能學,一、有關(guān)熱力學的一些基本概念,(一)、體系 宇宙 太陽系 地球 每個生物或非生物 化學反應(yīng)體系,熱,功,?,內(nèi)能的傳遞方式,?,動能、勢能轉(zhuǎn)化和傳遞的方式 包括機械功、電功、化學功等,(二)、能的兩種形式,體系總能量 = 可做功的能+ 不能做功的能 (H) (自由能G) (熱能),熱力學第一定律 (能量轉(zhuǎn)化與守恒定律),熱力學第二定律 (能量傳遞的方向性定律),當體系的狀態(tài)發(fā)生變化后,總能量不變 變化的是G( G),變化朝自由能降低的方向進行 (G ),,,二、化學反應(yīng)體系中的自由能,(一)根據(jù)自由能變化可以判斷中間
2、物質(zhì)代謝方向,狀態(tài) A,,,GA,狀態(tài) B,GB,G = GB GA,當反應(yīng)體系恒溫、恒壓下發(fā)生變化時, G0時,W0,體系對外作功,該反應(yīng)可自發(fā)進行,放能反應(yīng) G = 0時,W =0,該反應(yīng)處于平衡 G0時,W0,該反應(yīng)不可自發(fā)進行,必須吸收外來能量才能進行(吸能反應(yīng)),同時,該反應(yīng)的逆過程可以自發(fā)進行。,任何狀態(tài)下 G= GO + RTlnK GO這一反應(yīng)在標準狀態(tài)(pH=0, 25 1atm)的自由能變化(標準自由能)(可查表或計算,參見物理化學),與反應(yīng)的平衡常數(shù)有關(guān)。 K=B/A 或B1B2Bn/ A1A2An R:氣體常數(shù)(1.98x10-3 kcal/mol k
3、 ) ( 8.31x10 -3 kJ/mol k) T: 絕對溫度(k),生物代謝略有不同, GO改為GO(pH=7) G= GO + RTlnK,G0,可; =0,平衡;0,否,例:當 磷酸二羥丙酮 與 3-磷酸-甘 油醛 平衡時, 濃度比為 0.0475(Keq) pH=7, 25 1atm,該反應(yīng)平衡點時: 甘油醛-3-磷酸 K= = 4.75x10-2 磷酸二羥丙酮,,,判斷:當磷酸二羥丙酮為 3 x 10-6 mol/L,3-磷酸-甘油醛 為 2 x 10-4 mol/L 時,反應(yīng)怎樣進行?,G= GO + RTlnK 平衡時, G
4、= 0 K = Keq GO = - RTlnKeq = - 2.303RTlgKeq,GO = - RTlnKeq = - 2.303 x 1.98x10-3 x298 x log (0.0475) = 1.81kcal/mol,G = GO + RTln產(chǎn)物/反應(yīng)物 = 1.81kcal/mol +2.303 x 1.98x10-3 x298 x log 3 x 10-6 mol/L (甘) / 2 x 10-4 mol/L (丙) =-0.067 kcal/mol,(二)偶聯(lián)化學反應(yīng)標準自由能變化的可加性,熱力學上不利的反應(yīng)可以由熱力學上有利的 反應(yīng)所驅(qū)動,A B
5、 GO0 (不能自發(fā)進行),CD GO0 (能自發(fā)進行),A+C B+D GO0 (能自發(fā)進行),三、 高能化合物,定義:一般將水解時能夠釋放21 kJ /mol(5千卡/mol)以上自由能(G< -21 kJ / mol)的化合物稱為高能化合物。,高能化合物(水解)低能化合物 GO0 (能自發(fā)進行) ,A B GO0 (不能自發(fā)進行),A+高能化合物 B+低能化合物 GO0 (能自發(fā)進行),兩反應(yīng)如何可以結(jié)合在一起呢?,(一)功能,高能基團的傳遞,有著十分重要的生物意義,類似的活化反應(yīng)十分普遍存在。,D-6-磷酸葡萄糖比D-葡萄糖G高,更易于分解,這步活
6、化是細胞內(nèi)葡萄糖分解的第一步,也是后續(xù)葡萄糖分解的根基。,激酶激活底物(A)連接高能鍵的酶,例,激酶,(二)高能化合物的種類,1,磷氧鍵型(OP),(1)?;姿峄衔?1,3-二磷酸甘油酸,乙酰磷酸,10.1千卡/摩爾,11.8千卡/摩爾,氨甲酰磷酸,?;佘账?氨酰基腺苷酸,(2)焦磷酸化合物,ATP(三磷酸腺苷),焦磷酸,7.3千卡/摩爾,(3)烯醇式磷酸化合物,磷酸烯醇式丙酮酸,14.8千卡/摩爾,2, 氮磷鍵型,磷酸肌酸(N-甲基-胍基乙酸),磷酸精氨酸,10.3千卡/摩爾,7.7千卡/摩爾(蝦、蟹),這兩種高能化合物在生物體內(nèi)起儲存能量的作用。,3,硫酯鍵型,3-磷酸腺苷-5-磷酸
7、硫酸,?;o酶A,4, 甲硫鍵型,S-腺苷甲硫氨酸,(三)ATP的結(jié)構(gòu)特點,酸酐鍵,磷酯鍵,,,,,導致共價鍵不穩(wěn),1、酸酐鍵上的P爭奪電子,導致使氧橋的穩(wěn)定性降低,甚至斷裂。,2、pH=7時,ATP帶4個負電荷,互相排斥。,3、產(chǎn)物(ADP和磷酸)比ATP穩(wěn)定。,高能化合物由于內(nèi)在因素本身化學不穩(wěn)定(G高),水解產(chǎn)物穩(wěn)定(G低)。,(四)細胞內(nèi)影響ATP水解的因素 pH( pH越高,放出的能量越多),(五)ATP “能量中間體”,穩(wěn)定程度不同,各種高能化合物的Go有高低之分,,,,,,類似的活化反應(yīng)十分普遍存在。,D-6-磷酸葡萄糖比D-葡萄糖G高,更易于分解,這步活化是細胞內(nèi)葡萄糖分解的第
8、一步,也是后續(xù)葡萄糖分解的根基。,激酶激活底物(A)連接高能鍵的酶,例,激酶,,,作用:能量傳遞,轉(zhuǎn)化,傳遞,傳遞,磷酸肌酸(哺乳類),磷酸精氨酸(蝦、蟹),(六)磷酸肌酸和磷酸精氨酸 這兩種高能化合物在生物體內(nèi)起儲存能量的作用,H,磷酸肌酸 + ADP 肌酸 + ATP,,,G = G 1 + G2 = -43.1 +30.5 = -12.6 KJ/ mol,在機體中,由于反應(yīng)物和產(chǎn)物的濃度接近平衡點,所以,所以,當反應(yīng)物或產(chǎn)物的量有所變化時,機體會很靈敏地進行調(diào)節(jié),使反應(yīng)朝ATP生成或磷酸肌酸生成的方向進行。磷酸肌酸被稱為ATP緩沖劑。,(七)ATP斷裂成AMP 和焦磷酸,焦磷酸,7.7千卡/摩爾,2 -,,6.9千卡/摩爾,7.7 + 6.9 = 14.6千卡/摩爾,活化底物需要更多能量時,(八) 其他三磷酸核苷的遞能作用,能量源自,能源物質(zhì)(糖、脂、偶爾是蛋白質(zhì))的分解,分解代謝 氧化產(chǎn)能,ADP,,機械能(運動) 化學能(合成反應(yīng)) 滲透能(分泌、吸收) 電能(生物電) 熱能(體溫維持) 光能(生物發(fā)光),,,UTP、GTP、CTP、TTP 合成,供能,ATP,(九) 能荷,能 荷 =,ATP+1/2ADP,ATP+ADP +AMP,,分母是個定值,能荷在一定范圍內(nèi)波動(0.8-0.95),受到機體的嚴格調(diào)控。,