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1、第十一章 蛋白質(zhì)的生物合成
11-1 遺傳密碼 (下冊(cè) P504,37章)
蛋白質(zhì)是生物主要的功能分子,它參與所有的生命活動(dòng)過(guò)程,并起著主導(dǎo)作用。
蛋白質(zhì)的合成由核酸所控制,決定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的遺傳信息編碼在核酸分子中。
遺傳密碼:編碼氨基酸的核苷酸序列,通常指核苷酸三聯(lián)體決定氨基酸的對(duì)應(yīng)關(guān)系。
(一) 三聯(lián)密碼:
核酸分子中只有四種堿基,要為蛋白質(zhì)分子20種氨基酸編碼。三個(gè)堿基編碼64個(gè),又稱三聯(lián)密碼。
密碼子:mRNA上有三個(gè)相鄰核苷酸組成一個(gè)密碼子,代表某種氨基酸、肽鏈合成的起始或終止信號(hào)。
蛋白質(zhì)翻譯:在RNA控制下根據(jù)核酸鏈上每3個(gè)核苷酸決定一種氨基酸的
2、規(guī)則,合成出具有特定氨基酸順序的蛋白質(zhì)過(guò)程。
全部64個(gè)密碼子破譯后,編寫(xiě)出的遺傳密碼字典。見(jiàn)P511 表37-5。
(二) 遺傳密碼的基本特性
(1) 密碼的基本單位
遺傳密碼按5‘→3‘方向編碼,為不重疊、無(wú)標(biāo)點(diǎn)的三聯(lián)體密碼子。
起始密碼子兼Met:AUG。
終止密碼子:UAA、UAG和UGA。
其余61個(gè)密碼子對(duì)應(yīng)20種氨基酸。
(2) 密碼的簡(jiǎn)并性
同一種氨基酸有兩個(gè)或更多密碼子的現(xiàn)象稱為密碼的簡(jiǎn)并性。
同一種氨基酸不同密碼子稱為同義密碼子,氨基酸密碼子的簡(jiǎn)并見(jiàn)P512
表37-6。
簡(jiǎn)并可以減少有害突變,對(duì)物種穩(wěn)定有一定作用。
(3) 密碼的變偶性(擺動(dòng)性)
3、
編碼同一個(gè)氨基酸的密碼子前兩位堿基都相同,第三位堿基不同,為變偶性。即密碼簡(jiǎn)并性往往表現(xiàn)在密碼子第三位堿基上,如Gly的密碼子為GGU、GGC、和GGA。
(4) 密碼的通用性和變異性
通用性:各種低等和高等生物,包括病毒、細(xì)菌及真核生物基本上共用一套遺傳密碼。
變異性:已知線粒體DNA(mtDNA),還有原核生物支原體等少數(shù)生物基因密碼有一定變異。
(5) 密碼的防錯(cuò)系統(tǒng)
密碼的編排方式使得密碼子中一個(gè)堿基被置換,其結(jié)果常常是編碼相同的氨基酸或是為物理化學(xué)性質(zhì)接近的氨基酸取代。
11-2 蛋白質(zhì)合成及轉(zhuǎn)運(yùn) 下冊(cè) P517
1、氨基酸是怎樣被選擇及摻入到多肽鏈當(dāng)中去
4、的。
2、多肽鏈在核糖體上合成完后,其翻譯后化學(xué)修飾是怎樣進(jìn)行的。
3、合成加工好的蛋白質(zhì)是怎樣被運(yùn)送到其發(fā)揮功能的地方。
(一) mRNA是蛋白質(zhì)合成的模板
DNA在細(xì)胞核內(nèi),蛋白質(zhì)合成在細(xì)胞質(zhì)中,DNA的遺傳信息是由mRNA傳遞到蛋白質(zhì)上。mRNA是半壽期很短的物質(zhì),肽鏈上各個(gè)氨基酸排列順序是由mRNA上核苷酸排列順序決定的。
(二) tRNA轉(zhuǎn)運(yùn)活化的氨基酸至mRNA模板上
tRNA的3‘端為接受臂,是氨基酸結(jié)合部位。反密碼環(huán)含反密碼子,可識(shí)別mRNA密碼子,另外還有識(shí)別氨酰-tRNA合成酶的位點(diǎn)。
20種氨基酸每一種至少有一種tRNA負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)運(yùn),書(shū)寫(xiě)時(shí),將所轉(zhuǎn)運(yùn)的氨基酸寫(xiě)在
5、tRNA右上角,如tRNAphe只轉(zhuǎn)運(yùn)Phe,大多數(shù)氨基酸都有幾種專用來(lái)轉(zhuǎn)運(yùn)自己的tRNA。
(三) 核糖體是蛋白質(zhì)合成工廠
(1) 每個(gè)真核細(xì)胞可有106~107個(gè)核糖體。核糖體都有兩個(gè)亞基組成(原核生物為30S和50S,真核生物為40S和60S),每個(gè)核糖體有兩個(gè)tRNA位點(diǎn):一個(gè)A位,氨酰tRNA位點(diǎn);另一個(gè)P位,肽酰tRNA位點(diǎn)。
(2) 還有結(jié)合mRNA的位點(diǎn),一個(gè)mRNA分子可以與一定數(shù)目的單個(gè)核糖體結(jié)合,形成念珠狀,稱為多核糖體。
(3) 核糖體還有許多與起始因子、延伸因子、釋放因子及與各種酶結(jié)合的位點(diǎn)。
r-RNA在核糖體中即有結(jié)構(gòu)上的功能,又參與轉(zhuǎn)譯過(guò)程。
(四)
6、 翻譯的步驟
肽鍵合成時(shí)延伸的方向是從N端到C端,mRNA上信號(hào)被轉(zhuǎn)譯的方向是從5‘端到3‘端。
(1) 氨酰-tRNA的形成
在氨酰-tRNA合成酶作用下完成,使氨基酸活化。該酶有較高的專一性,即對(duì)氨基酸又對(duì)tRNA有高度選擇性,以防止錯(cuò)誤的氨基酸摻入多肽。且可校正錯(cuò)誤,錯(cuò)誤活化的氨基酸可被水解下來(lái)。
一旦形成氨酰-tRNA后,氨基酸的去向就由tRNA來(lái)決定。
(2) 翻譯開(kāi)始于mRNA與核糖體的結(jié)合
大腸桿菌多肽合成的第一步是70S起始復(fù)合物的形成,mRNA上的起始密碼子AUG,30S及50S核糖體亞基,起始氨基酸及起始tRNA等參與這一復(fù)雜過(guò)程。
(3) 肽鏈的延伸分三步進(jìn)
7、行:一個(gè)新進(jìn)入的氨酰-tRNA結(jié)合到70S核糖體A位點(diǎn)上,然后肽?;鶑腜位點(diǎn)轉(zhuǎn)到A位點(diǎn)上,并形成肽鍵。核糖體沿mRNA位移,mRNA上的下一個(gè)密碼子又進(jìn)入A位點(diǎn)。氨酰-tRNA從A位點(diǎn)上移位到P位點(diǎn),tRNA離開(kāi)P位點(diǎn),完成延長(zhǎng)一個(gè)氨基酸的肽鏈合成。然后再開(kāi)始新的一輪肽鏈延伸反應(yīng)。
(4) 肽鏈合成的終止和釋放,翻譯的終止需要釋放因子和終止因子的參加,這一過(guò)程除了需要mRNA的終止信號(hào)外,還需要核糖釋放因子參與核糖體與mRNA的解離。釋放因子在A位結(jié)合,肽鏈水解離開(kāi)核糖體,核糖體離解成亞基,mRNA離開(kāi)。
(5) 真核細(xì)胞中情況略有不同,起始復(fù)合物大小為80S,起始氨基酸為甲硫氨酸(而不是原核細(xì)胞所用的N-甲酰甲硫氨酸),起始tRNA也不同,起始密碼子為AUG。涉及到的蛋白因子也較多。肽鏈延伸與終止過(guò)程中的延伸因子與信號(hào)釋放因子也不同。
(6) 許多抗生素和毒素是多肽合成抑制劑,如氯霉素、四環(huán)素、鏈霉素等只抑制原核細(xì)胞的翻譯,但不作用于真核細(xì)胞。