《《RNA的生物合成》課件》由會員分享,可在線閱讀,更多相關《《RNA的生物合成》課件(40頁珍藏版)》請在裝配圖網上搜索。
1、生 物 化 學 教 研 室(Chapter 16: RNA Biosynthesis) 生 物 化 學 教 研 室 目 的 要 求 生 物 化 學 教 研 室 生 物 化 學 教 研 室 一 、 轉 錄 的 定 義 及 與 復 制 的 比 較1.轉 錄 的 定 義以 DNA為 模 板 , 以 四 種 核 糖 核 苷 酸 為 原 料 , 在 RNA聚 合酶 催 化 下 , 合 成 RNA的 過 程 。2.轉 錄 與 復 制 的 比 較 生 物 化 學 教 研 室 二 、 參 與 轉 錄 的 物 質( 一 ) DNA模 板( 二 ) RNA聚 合 酶( 三 ) 合 成 RNA的 原 料( 四 )
2、終 止 因 子 ( 因 子 ) 生 物 化 學 教 研 室 ( 一 ) 模 板三 種 RNA都 是 以 DNA為 模 板 , RNA聚 合 酶 是 以 其中 的 一 條 鏈 的 某 一 節(jié) 段 為 模 板 , 該 鏈 稱 為 模 板鏈 , 另 一 條 鏈 為 編 碼 鏈 。 生 物 化 學 教 研 室 模 板 生 物 化 學 教 研 室 ( 二 ) RNA聚 合 酶1. 原 核 生 物 RNA聚 合 酶由 五 個 亞 基 構 成 : 22 構 成 核 心 酶 , 與 因子 一 起 構 成 全 酶因 子 可 幫 助 辨 認 轉 錄 起 始位 點 。核 心 酶 催 化 3,5-磷 酸 二 酯鍵 的
3、 形 成 合 成 RNA。 RNA聚合酶亞單位示意圖 生 物 化 學 教 研 室 原 核 生 物 RNA聚 合 酶 亞 基 的 功 能識別并結合上游啟動子元件,決定哪些基因被轉錄含活性中心,催化3,5-磷酸二酯鍵的形成結合DNA模板,解鏈協(xié)助核心酶識別并結合啟動子元件,辨認轉錄起始位點未知 生 物 化 學 教 研 室 ( 二 ) RNA聚 合 酶2. 真 核 生 物 RNA聚 合 酶分 類 分 布 作 用RNA聚 合 酶 (A) 核 仁 28S、 18S、 5.8SrRNA共 同 前 體45SRNA的 合 成RNA聚 合 酶 (B) 核 質 各 種 mRNA前 體 的 合 成 和 U1U13s
4、nRNA前 體 ( U6snRNA除 外 ) 的 合 成RNA聚 合 酶 (C) 核 質 各 種 tRNA、 5SrRNA、 U 6snRNA以 及 非U族 snRNA等 前 體 的 合 成 真 核 生 物RNA聚 合 酶與 大 腸 桿菌 RNA聚 合酶 的 比 較 生 物 化 學 教 研 室真 核 生 物 RNA-pol的 大 亞 基 蛋 白 質 的 C端 氨基 酸 序 列 為 (YSPTSPS, 酪 絲 脯 蘇 絲 脯 絲 )n,不 同 物 種 n值 不 同 , 是 由 含 羥 基 氨 基 酸 為 主 體的 重 復 序 列 , 稱 為 羧 基 末 端 結 構 域 ( CTD) 。 生 物
5、化 學 教 研 室 ( 三 ) 合 成 RNA的 原 料四 種 核 苷 三 磷 酸 : ATP、 G TP、 CTP、 UTP二 價 金 屬 離 子 : Mg2+、 Mn2+是 RNA聚 合 酶 的必 需 輔 助 因 子 。 生 物 化 學 教 研 室 ( 四 ) 終 止 因 子 ( 因 子 )因 子 在 特 殊 的 位 點 上 停 止 RNA的 合 成 , 又 叫 終止 蛋 白 。 生 物 化 學 教 研 室 一 、 轉 錄 起 始1、 啟 動 子2、 原 核 生 物 的 轉 錄 起 始3、 真 核 生 物 的 轉 錄 起 始 生 物 化 學 教 研 室 1、 啟 動 子啟 動 子 (pro
6、moter, P)是 指 能 被 RNA聚 合 酶 識 別、 結 合 并 啟 動 基 因 轉 錄 的 一 段 DNA序 列 , 位 于轉 錄 起 始 點 的 上 游 。不 同 的 啟 動 子 啟 動 轉 錄 的 活 性 不 同 , 在 原 核 生物 和 真 核 生 物 的 啟 動 子 序 列 中 都 有 一 些 保 守 序列 。 生 物 化 學 教 研 室 1、 啟 動 子原 核 生 物 啟 動 子 :-10bpTATAAT( Pribnow盒 )-35bpTTGACA真 核 生 物 啟 動 子 :-25 -30bpTATA盒 ( 即 Hogness盒 )-30 -110bpCAAT盒 和 G
7、C盒 原核生物啟動子 真核生物啟動子 生 物 化 學 教 研 室 2、 原 核 生 物 的 轉 錄 起 始RNA聚 合 酶 以 全 酶 形 式 與 雙 鏈 DNA結 合 , 通 過 因 子 識 別 模 板 鏈 并 與 啟 動 子 結 合 形 成 復 合 物 ,然 后 進 行 解 鏈 。 以 四 種 核 苷 三 磷 酸 為 原 料 , 按堿 基 配 對 的 原 則 結 合 到 模 板 鏈 上 , 第 一 個 多 為ATP。 生 物 化 學 教 研 室 RNA聚 合 酶 與 啟 動 子 的 結 合 生 物 化 學 教 研 室 3、 真 核 生 物 的 轉 錄 起 始真 核 生 物 的 轉 錄 起
8、始 較 原 核 生 物 復 雜 得 多 , 需要 轉 錄 因 子 ( TF) 的 參 與 , 同 時 還 需 要 很 多 其他 的 輔 助 因 子 的 幫 助 才 能 啟 動 轉 錄 。 其 中 參 與RNA聚 合 酶 合 成 mRNA的 轉 錄 因 子 為 TF , 包括 有 TF A、 TF B、 TF D、 TF E、 TF F。TF D能 通 過 TATA盒 結 合 亞 基 (TBP)和 與 啟 動 子的 TATA盒 結 合 。 生 物 化 學 教 研 室 二 、 延 長 階 段當 合 成 大 約 8個 寡 核 苷 酸 時 , 因 子 即 脫 離 核 心酶 。 核 心 酶 在 DNA鏈
9、 上 不 斷 滑 動 , 每 滑 動 一 個核 苷 酸 距 離 , 即 有 一 個 與 模 板 鏈 互 補 的 5-NTP進 入 , 形 成 3,5-磷 酸 二 酯 鍵 。 合 成 的 方 向 是53, 在 模 板 鏈 上 滑 動 的 方 向 則 是 35。 核苷酸鏈的延伸 生 物 化 學 教 研 室 轉 錄 泡 生 物 化 學 教 研 室 三 、 終 止 階 段 模 板 DNA具 有 終 止 信 號 , 它 是 特 殊 的 堿 基 順 序, 可 被 RNA聚 合 酶 或 因 子 識 別 , 轉 錄 終 止 。 新合 成 的 RNA、 核 心 酶 、 因 子 均 從 模 板 鏈 上 釋 放出
10、來 。 核 心 酶 又 與 因 子 結 合 構 成 全 酶 。 生 物 化 學 教 研 室 不 依 賴 于 因 子 的 終 止 子 ( 強 終 止 子 )不 依 賴 于 因 子 的 終 止 子 有 兩 個 特 征 :DNA順 序 有 富 含 GC的 反 向 重 復 序 列 , 位 于 RNA3端 之 前 15-20核 苷 酸 處 ,DNA模 板 鏈 中 在 反 向 重 復 序 列 之 后 有 一 串 約 68個 A, 轉 錄 為 RNA3端 的 U。 強終止子 不依賴于因子的轉錄終止 生 物 化 學 教 研 室 依 賴 于 因 子 的 轉 錄 終 止依 賴 于 因 子 的 終 止 子 也 可
11、以 形 成 發(fā) 夾 結 構 ,但 是 后 面 沒 有 不 依 賴 的 終 止 子 特 有 的 多 聚 dA序 列 。 因 子 先 與 轉 錄 生 成 的 RNA結 合 , 借 助 水 解 ATP的 能 量 向 前 移 動 , 即 追 趕 RNA聚 合 酶 , 當 轉 錄生 成 的 RNA形 成 發(fā) 夾 結 構 時 , 使 因 子 追 趕 上RNA聚 合 酶 , 導 致 RNA-DNA之 間 的 結 合 不 穩(wěn) 定 ,使 RNA脫 離 模 板 。 依賴于因子的轉錄終止 生 物 化 學 教 研 室 四 、 轉 錄 的 特 點 1. 不 對 稱 性2. 具 有 方 向 性 生 物 化 學 教 研 室
12、 真 核 生 物 mRNA的 轉 錄 后 加 工 修 飾 生 物 化 學 教 研 室 原 核 生 物 前 體 tRNA的 轉 錄 后 加 工原 核 生 物的 加 工 包括 5和 3旁 序 列 的切 除 和 個別 堿 基 的修 飾 。 生 物 化 學 教 研 室 真 核 生 物 的 前 體 tRNA的 轉 錄 后 加 工 生 物 化 學 教 研 室 原 核 生 物 前 體 rRNA轉 錄 后 加 工 真 核 生物 前 體rRNA的轉 錄 后加 工 生 物 化 學 教 研 室 四 、 核 酶 在 轉 錄 修 飾 中 的 作 用核 酶 概 念 的 提 出 : 在 研 究 四 膜 蟲 時 發(fā) 現(xiàn) , 其rRNA能 進 行 自 我 剪 接 , 在 沒 有 蛋 白 質 的 情 況 下, 剪 接 反 應 仍 可 完 成 。 因 此 , 將 這 種 具 有 催 化作 用 的 RNA命 名 為 核 酶 。其 二 級 結 構 為 槌 頭 結 構 , 這 是 核 酶 起 作 用 的 結構 要 求 。